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冷冻干燥机常用于果蔬、肉禽、水产、调味品、方便食品及名优特产等干燥，因此本产品也称为食品冻干机，保持食品原有的色、香、味、形、新鲜度不变的目的，且复水性好，成品便于储存和运输，费用降低，保存期延长。
药材行业在干燥蜂王浆、人参、龟、鳖、蚯蚓等营养，采用真空冷冻干燥工艺，好的保留了原有的营养，使人们相信该营养品纯真自然。
制药行业用于、血浆、疫苗、酶、、等中西药品的脱水与保存。
生物研究利用真空冷冻干燥技术长期保存的血液、细菌、动脉、骨骼、皮肤、角膜、神经组织和各种器官，在使用时只需供给水份即可再生，仍保持其生物理特性。
好处：
1、冷冻干燥在低温下进行因此对于许多热敏性的物质特别适用。如蛋白质、微生物之类不会发生变性或失去生物活力。因此在医药上得到广泛地应用；
2、由于在冻结的状态下进行干燥因此体积几乎不变保持了原来的结构不会发生浓缩现象；
3、干燥后的物质疏松多孔呈海绵状加水后溶解而几乎立即恢复原来的性状；
4、由于冷冻干燥机干燥在真空下进行氧气少因此一些易氧化的物质得到了保护；
5、在低温下干燥时物质中的一些挥发性成分损失很小适合一些化学产品和食品干燥；
6、在冷冻干燥过程中微生物的生长和酶的作用无法进行因此能保持原来的性装；
7、干燥能排除95-99%以上的水份使干燥后产品能长期保存而不致变质；
8、由于物料中水分在预冻以后以冰晶的形态存在，原来溶于水中的无机盐类溶解物质被均匀地分配在物料之中；
9、干燥后的物质疏松多孔，呈海绵状，加水后溶解而，几乎立即恢复原来的性状；
10、由于干燥在真空下进行，氧气少，因此一些易氧化的物质进行干燥得到了保护。
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